Prof. MUDr. Jiří Jonák, DrSc.

Osobní profil

Národnost	česká
Kontakt adresa pracoviště	Ústav lékařské biochemie a laboratorní diagnostiky, 1.lékařská fakulta UK a Všeobecná fakultní nemocnice v Praze, Kateřinská 32, 12108 Praha 2; Ústav molekulární genetiky AV ČR, v.v.i., Vídeňská 1083, 14220 Praha 4
e-mail	jiri.jonak@img.cas.cz
telefon	224 964 270; 241 063 273

Vzdělání

• 1964 - MUDr., Fakulta všeobecného lékařství UK, Praha
• 1968 - CSc., obhajoba kandidátské disertační práce s názvem: „Vazebná místa pro peptidyl-tRNA na 30S a 50S ribosomálních podjednotkách Escherichia coli“. Ústav organické chemie a biochemie ČSAV, Praha

Postavení    

• 1961-1964, asistent-učitel IV. třídy, 1. ústav pro chemii lékařskou a soudní, Fakulta všeobecného lékařství UK, Praha

• 1968-1977, vědecký pracovník, Ústav organické chemie a biochemie ČSAV, Praha

• 1977-dosud, vědecký pracovník a vedoucí vědecký pracovník, Ústav molekulární genetiky AVČR, v.v.i., Praha

• 1989-1999, vědecký sekretář, Ústav molekulární genetiky AVČR, v.v.i.,Praha
• 1990-2000, externí lektor, Ústav lékařské biochemie, 1.LF UK (dříve 1. ústav pro chemii lékařskou a soudní, Fakulta všeobecného lékařství UK), Praha

• 1990-2006, vedoucí Oddělení proteosyntézy, později Oddělení genové exprese, Ústav molekulární genetiky AVČR, v.v.i., Praha

• 1990-dosud, hlavní organizátor, přednášející a garant každoročního 14-denního kurzu pro PhD studenty v biomedicině s názvem „Pokroky v molekulární biologii a genetice“

• 1992-2006, zakládající člen a člen předsednictva (1993-1997) Centra postgraduálního doktorského studia v biomedicině a Koordinační rady postgraduálního doktorského studia v biomedicině (PDSB) při UK a AV ČR – zavedení a koordinace společného školícího systému pro PhD studenty v oboru biomedicína v  obou těchto institucích

• 1992-dosud, člen Oborové rady doktorského (PhD) studijního programu Molekulární a buněčná biologie, genetika a virologie v rámci PDSB pro 1.LF, 2.LF, 3.LF UK, Přírodovědeckou fakultu UK a příslušné ústavy AV ČR.

• 1993, 1995, lektor, vždy 1-měsíční přednášky a semináře pro studenty, Chemická fakulta University v Aarhusu, Dánsko

• 1995 - docent, molekulární a buněčná biologie, Ústav lékařské biochemie, 1.LF UK, Praha

• 1995-2001, Howard Hughes Medical Institute Research Scholar

• 1996 - DrSc., biologické vědy, Universita Karlova, Praha. Disertační práce: Strukturně funkční vztahy v elongačním faktoru EF-Tu – regulační bílkovině proteosyntézy

• 1998-2003, Grantová agentura ČR, člen a předseda (2001-2002) podoborové komise lékařských věd, člen Oborové komise lékařské vědy (1998-2001)

• 1998-2010, zahraniční člen Komise pro obhajoby doktorských disertačních prací (DrSc.) ve vědním oboru 15-03-9 genetika, Slovenská republika
• 2000-2007, odborný pracovník VŠ, Ústav lékařské biochemie, 1.LF UK, Praha
• 2000-dosud, koordinátor a odborný poradce pro práci s GMO, Ústav molekulární genetiky AV ČR, v.v.i., Praha
• 2006-dosud, člen Vědeckého výboru pro geneticky modifikované potraviny a krmiva při Ministerstvu zemědělství ČR
• 2007-dosud, profesor, lékařská chemie a biochemie, Ústav lékařské biochemie a laboratorní diagnostiky (dříve Ústav lékařské biochemie), 1.LF UK, Praha

Zahraniční stáže

• Laboratory of Molecular Biology, MRC, Cambridge, Anglie
• Ústav pro výzkum bílkovin AV SSSR, Puščino, Rusko
• Institute of Molecular Biology a Institute of Chemistry, Aarhus University, Aarhus, Dánsko
• École Polytechnique, Palaiseau, Francie
• Universität Bayreuth, Spolková republika Německo

Člen vědeckých společností

• Česká společnost pro biochemii a molekulární biologii (1966-2007)
• National Geographic Society (1980-2012)
• EACR (European Association for Cancer Research) (1989-2007)
• Česká lékařská společnost JEP, onkologická sekce (2000-dosud)

Ocenění

• 1969, 1970, 1981: Cena ČSAV
• 1978: Premie Českého literárního fondu za nejlepší publikaci v Biologických listech za r. 1977
• 1987: Medaile J.E. Purkyně
• 1995-2001: Grant od Howard Hughes Medical Institute (USA)

Současné profesní zájmy

• Bakteriální proteosyntéza: Struktura a funkce komponent proteosyntetického systému u bakterií. Elongační faktory EF-Tu: doménová struktura, GTPásová aktivita a termostabilita.
• Sbalování bílkovin a jeho poruchy.

Publikační aktivita

Autor a spoluautor cca 117 publikací v tuzemských a zahraničních časopisech, monografiích a sbornících, editor a spoluautor 8 sborníků s názvem „Molekulární biologie a genetika V. – XII.“ (1990-2006). Přednášející, organizátor a předseda na mnoha konferencích doma i v zahraničí.

K 6.3.2018 se uvádí 1485 ohlasů prací a to v databázi Web of Science Core Collection 848 ohlasů a k tomu navíc v databázi Scopus 637 ohlasů další práce nesledované ve WoS.

H-index podle WoS = 19

Vybrané publikace za posledních 15 let

1. Šanderová, H., Hůlková, M., Maloň, P., Kepková, M. and Jonák, J.: Thermostability of multidomain proteins: Elongation factors EF-Tu from Escherichia coli and Bacillus stearothermophilus and their chimeric forms. Protein Science 13(2004)89-99
2. Šanderová, H. and Jonák, J.: Opposite roles of domains 2+3 of Escherichia coli EF-Tu and Bacillus stearothermophilus EF-Tu in the regulation of EF-Tu GTPase activity. Biochim. Biophys. Acta-Proteins and Proteomics 1752(2005)11-17
3. Šindelka, R., Ferjentsik, Z. and Jonák, J.: Developmental expression profiles of Xenopus laevis reference genes. Developmental Dynamics 235(2006)754-758
4. Kubista, M., Andrade, J.M., Bengtsson, M., Forootan, A., Jonák, J., Lind, K., Šindelka, R., Sjöback, R., Sjögreen, B., Strömbom, L., Ståhlberg, A., and Zoric, N.: The real-time polymerase chain reaction. Review. Mol. Asp. Med. 27(2006)95-125
5. Jonák, J.: Bacterial elongation factors EF-Tu, their mutants, chimeric forms and domains: Isolation and purification. J. Chromatography B 849(2007)141-153
6. Sojka, L., Fučík, V., Krásný, L., Barvík, I. and Jonák, J.: YbxF, a protein associated with exponential-phase ribosomes in Bacillus subtilis. J. Bacteriol. 189(2007)4809-4814
7. Šindelka, R., Jonák, J., Hands, R., Bustin, S.A. and Kubista, M.: Intracellular expression profiles measured by real-time PCR tomography in the Xenopus laevis oocyte. Nucl. Acids Res. 36(2008)387-392
8. Krásný, L., Tišerová, H., Jonák, J., Rejman, D., and Šanderová, H.: The identity of the transcription +1 position is crucial for changes in gene expression in response to amino acid starvation in Bacillus subtilis. Molec. Microbiol. 69(2008)42-54
9. Kolberg, J., Hammerschmidt, S., Frank, R., Jonák, J., Šanderová, H., and Aase, A.: The surface-associated elongation factor Tu is concealed for antibody binding on viable pneumococci and meningococci. FEMS Immunol. Med. Microbiol. 53(2008)222-230
10. Ferjentsik, Z., Šindelka, R., and Jonák, J.: Expression patterns of Src-family tyrosine kinases during Xenopus laevis development. Int. J. Dev. Biol. 53(2009)163-168
11. Šanderová, H., Tišerová, H., Barvík, I., Sojka, L., Jonák, J. and Krásný, L.: The N-terminal region is crucial for the thermostability of the G-domain of Bacillus stearothermophilus EF-Tu. Biochim. Biophys. Acta-Proteins and Proteomics 1804(2010)147-155
12. Motáčková, V., Šanderová H., Žídek, L., Nováček, J., Padrta, P., Švenková, A., Korelusová, J., Jonák, J., Krásný, L. and Sklenář, V.: Solution structure of the N-terminal domain of Bacillus subtilis delta subunit of RNA polymerase and its classification based on structural homologs. Proteins-Structure Function and Bioinformatics 78(2010)1807-1810
13. Sojka, L., Kouba, T., Barvík, I., Šanderová, H., Maderová, Z., Jonák, J. and Krásný, L.: Rapid changes in gene expression: DNA determinants of promoter regulation by the concentration of the transcription initiating NTP in Bacillus subtilis. Nucl. Acids Res. 39(2011)4598-4611